Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms