Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms