Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RAB23Q9ULC3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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RAB23Q9ULC3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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RAB23Q9ULC3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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