Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms