Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms