Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms