Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF7Q9UBF6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms