Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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