Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms