Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms