Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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