Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms