Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms