Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD11Q9BXL7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD11Q9BXL7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms