Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms