Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRACR2AQ9BSW2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms