Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms