Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3AQ96ST3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms