Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms