Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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