Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms