Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ZNF548Q8NEK5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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