Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms