Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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USP53Q70EK8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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USP53Q70EK8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP53Q70EK8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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