Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms