Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms