Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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