Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 GALE-212ENST00000470383 2073 ntTSL 225.57■■□□□ 1.685e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.645e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 ASPHD1-205ENST00000566693 1732 ntTSL 1 (best)23.9■■□□□ 1.425e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TMEM141-205ENST00000484854 567 ntTSL 323.53■■□□□ 1.365e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-206ENST00000562142 518 ntTSL 323.4■■□□□ 1.342e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 1424 ntTSL 223.36■■□□□ 1.335e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 ASPHD1-202ENST00000414952 1451 ntTSL 222.93■■□□□ 1.265e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAP4K5-204ENST00000554273 484 ntTSL 322.38■■□□□ 1.175e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.125e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-216ENST00000566117 529 ntTSL 521.62■■□□□ 1.052e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.975e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.946e-13■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.915e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.95e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.896e-13■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TRIM8-202ENST00000462202 891 ntTSL 520.41■□□□□ 0.865e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.825e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 GALE-209ENST00000467070 556 ntTSL 319.84■□□□□ 0.775e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PPP2R3B-201ENST00000381625 782 ntTSL 519.62■□□□□ 0.735e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.75e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.696e-13■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.695e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 GALE-208ENST00000466250 598 ntTSL 219.17■□□□□ 0.665e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 ASPHD1-204ENST00000563177 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.07■□□□□ 0.645e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TRIM8-204ENST00000487927 761 ntTSL 318.99■□□□□ 0.635e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 SMYD2-203ENST00000460580 1618 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.615e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PSMB5-201ENST00000334454 796 ntTSL 518.27■□□□□ 0.525e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.525e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.525e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.515e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 SCAI-205ENST00000477186 1808 ntTSL 218.21■□□□□ 0.515e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.55e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 WSB2-207ENST00000540129 1524 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.395e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 STX18-AS1-203ENST00000507244 669 ntTSL 217.47■□□□□ 0.395e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 LSM14A-207ENST00000589878 559 ntTSL 416.9■□□□□ 0.35e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.285e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.275e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TNK2-209ENST00000430929 829 ntTSL 516.72■□□□□ 0.275e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.225e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.215e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.25e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 GALE-202ENST00000418277 882 ntTSL 516.25■□□□□ 0.195e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 FARS2-204ENST00000602691 562 ntTSL 316.21■□□□□ 0.195e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TMEM141-203ENST00000479737 491 ntTSL 216.18■□□□□ 0.185e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 STX18-AS1-204ENST00000512438 549 ntTSL 316.18■□□□□ 0.185e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 GALE-207ENST00000459934 1563 ntTSL 516.1■□□□□ 0.175e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAP4K5-209ENST00000557390 545 ntTSL 316.04■□□□□ 0.165e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 JPT2-211ENST00000567717 857 ntTSL 315.91■□□□□ 0.145e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 STX18-AS1-202ENST00000502693 724 ntTSL 315.71■□□□□ 0.115e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-217ENST00000566318 688 ntTSL 315.63■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.055e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.035e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TMEM259-206ENST00000589055 791 ntTSL 314.84□□□□□ -0.035e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TNK2-219ENST00000481865 5940 ntTSL 514.71□□□□□ -0.055e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 NEURL4-206ENST00000571887 4291 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.58□□□□□ -0.086e-13■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.095e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.095e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.145e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-211ENST00000563926 594 ntTSL 414.14□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-204ENST00000561742 379 ntTSL 314.14□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 SMYD2-204ENST00000471645 4732 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.155e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TNK2-211ENST00000438207 870 ntTSL 514.08□□□□□ -0.165e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 LSM14A-205ENST00000586157 944 ntTSL 513.86□□□□□ -0.195e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TMEM141-202ENST00000465017 839 ntTSL 213.81□□□□□ -0.25e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TMEM141-204ENST00000483187 683 ntTSL 213.81□□□□□ -0.25e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.215e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.224e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.235e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.255e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAN2C1-220ENST00000564785 4820 ntTSL 513.46□□□□□ -0.264e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAN2C1-212ENST00000563441 2664 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.274e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 WSB2-208ENST00000542726 587 ntTSL 213.27□□□□□ -0.295e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PSMB5-206ENST00000555895 444 ntTSL 313.23□□□□□ -0.295e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.295e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.295e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.36e-13■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-209ENST00000563787 701 ntTSL 313.16□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TNK2-214ENST00000464041 3545 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.35e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAP4K5-203ENST00000554091 619 ntTSL 312.96□□□□□ -0.335e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-208ENST00000563002 541 ntTSL 512.92□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TMEM259-212ENST00000607316 477 ntTSL 212.88□□□□□ -0.355e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 SMYD2-206ENST00000491455 3809 ntTSL 212.8□□□□□ -0.365e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TMEM259-203ENST00000586250 418 ntTSL 312.76□□□□□ -0.375e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-218ENST00000568746 2900 ntTSL 212.61□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 SMAD2-210ENST00000587421 575 ntTSL 412.57□□□□□ -0.45e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 GALE-203ENST00000425913 876 ntTSL 512.49□□□□□ -0.415e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MRPS27-204ENST00000508863 956 ntTSL 312.3□□□□□ -0.445e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MRPS27-213ENST00000522404 550 ntTSL 412.15□□□□□ -0.465e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.54e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.524e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 TMEM141-206ENST00000489739 551 ntTSL 311.63□□□□□ -0.555e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 WSB2-206ENST00000537945 795 ntTSL 311.36□□□□□ -0.595e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.615e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-205ENST00000561946 611 ntTSL 311.04□□□□□ -0.642e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 WSB2-204ENST00000536602 1008 ntTSL 210.79□□□□□ -0.685e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-202ENST00000395762 3685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-6■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 MRPS27-205ENST00000513900 1369 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.735e-7■■■□□ 16.3
PCBP2Q15366 IL4R-203ENST00000543915 3539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-6■■■□□ 16.3
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 209.5 ms