Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAM2Q15035 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms