Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOFQ13790 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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