Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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