Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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