Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms