Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATRQ13535 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRQ13535 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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