Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms