Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms