Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms