Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms