Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDR2Q01850 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms