Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HERVK_113P63121 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms