Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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