Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLF3P57682 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLF3P57682 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms