Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms