Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB28P51157 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB28P51157 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB28P51157 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB28P51157 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB28P51157 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB28P51157 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB28P51157 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB28P51157 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB28P51157 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB28P51157 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB28P51157 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RAB28P51157 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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