Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A3P48751 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A3P48751 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A3P48751 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms