Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms