Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms