Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms