Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

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Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCND1P24385 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCND1P24385 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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