Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DESP17661 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DESP17661 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DESP17661 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DESP17661 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DESP17661 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DESP17661 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DESP17661 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DESP17661 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DESP17661 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms